企业被税务机关列入“黑户”的原因可能有以下几种：
公司不经营也不报税，并且没有正常注销：
这种情况下，企业会成为税务遗留问题，滞纳金和罚款会不断累积，最终导致企业被列入异常名单。
公司失联、走逃，成为非正常户，被评为D级纳税人：
这类公司虽然没有注销，但其行为会影响同一法定代表人或财务负责人关联的其他公司的税务评级。
重大税收违法事件：
涉及虚假申报、逃避税款、骗取出口退税、虚开增值税发票等严重违法行为，且涉及金额较大时，企业会被公示并进入联合惩戒名单。
建议企业及时申报并妥善处理税务事宜，避免因违反税务规定而成为“黑户”。如果企业已经出现异常情况，应尽快与税务机关联系，了解具体情况并采取相应措施解决问题。