竣工备案表由 工程所在地的县级以上地方人民政府建设主管部门负责出具。具体来说，国务院建设行政主管部门负责全国房屋建筑工程和市政基础设施工程的竣工验收备案管理工作，而县级以上地方人民政府建设行政主管部门则负责本行政区域内工程的竣工验收备案管理工作。
在实际操作中，建设单位在工程竣工验收合格之日起15日内，需要向工程所在地的县级以上地方人民政府建设主管部门提交包括工程竣工验收备案表在内的相关文件进行备案。
因此，建议建设单位在办理竣工备案时，提前咨询当地的建设行政主管部门，以确保流程顺利进行并符合相关法规要求。