办理港澳通行证签注的方法如下：
网上办理
申请人可以登录“国家移民管理局政务服务平台”进行在线申请，填写相关信息并选择受理公安机关，最后提交审核即可。
自助签注机办理
申请人可以前往就近的公安机关出入境管理窗口，在自助签注机上办理签注。具体操作步骤包括插入港澳通行证、选择签注种类和次数、核对签注信息、进行人脸识别等。
现场申请
申请人可以前往公安机关出入境管理窗口，提交填写完整的签注申请表、本人居民身份证原件及复印件、有效的港澳通行证等材料，进行现场申请。签注的有效期一般为1年，可以在有效期内多次使用。
注意事项：
签注类型包括个人旅游、团队旅游、探亲等，申请人可以根据自己的需求选择签注类型。
首次办理港澳通行证通常会包含一次签注，如果是再次签注，只需出示有效港澳通行证即可办理。
办理签注的费用不同，单次签注是15元，一年多次签注是80元。
提交申请后，通常需要7-10个工作日予以签发，申请人可以选择线下领取或邮寄。
建议选择离自己最近和方便的办理方式，提前准备好所需材料，以确保顺利办理港澳通行证签注。