申请劳动仲裁对公司有以下影响：
劳动法保护劳动者，公司败诉赔偿可能性较大
劳动仲裁的法律原则更偏向于保护弱势一方，即劳动者。因此，公司在劳动仲裁中败诉并需要赔偿的可能性较大。
留下不良记录
败诉的裁判文书会上网公开，如企查查、天眼查等，这会使企业的法律纠纷被其他公司或员工知晓，从而对企业的声誉产生负面影响。
影响公司经营发展
劳动纠纷会影响公司在机构招标评估和上市综合考量中的表现。频繁的劳动纠纷可能会影响公司的声誉和信用，进而影响业务合作和融资能力。
员工效仿
如果员工带头申请劳动仲裁并且胜诉，其他员工可能会效仿，这会增加公司处理劳动纠纷的成本和时间。
法律义务履行
公司需要依法参与劳动争议仲裁委员会组织的仲裁，并按照规定的期限履行发生法律效力的调解书、裁决书。拒不履行可能会面临法院强制执行。
财务成本
劳动仲裁可能导致公司需要支付额外的经济成本，如赔偿金、经济补偿金等。败诉后，公司需按照裁决结果履行义务，否则可能面临财产被查封、扣押等强制执行措施。
内部管理改进
劳动仲裁案件的出现可能暴露出企业在劳动用工制度等方面的漏洞和不足，促使企业反思并改进内部管理流程，以避免类似问题再次发生。
综上所述，申请劳动仲裁可能会对公司的声誉、经营发展、财务状况和内部管理产生多方面的影响。因此，建议企业在面临劳动纠纷时，尽量通过协商或其他合法途径解决问题，以减少不必要的法律风险和经济损失。