年薪制的工资发放和个人所得税计算方法如下：
工资发放
每月预付：企业应当每月预付工资，即使年薪是在年终结算的。这意味着员工每月会收到一部分年薪，通常是基本年薪的一部分。
年终结算：剩余的年薪（包括绩效年薪和保证金）会在年终进行结算，并一次性支付给员工。
个人所得税计算
个人所得税：年薪需要缴纳个人所得税。根据《国家税务总局关于调整个人取得全年一次性奖金等计算征收个人所得税方法问题的通知》，实行年薪制的单位，个人在年终兑现的年薪比照全年一次性奖金的规定计算缴纳个人所得税。
计算方法：
如果员工在发放年薪的当月工资薪金所得高于（或等于）税法规定的费用扣除额，则应纳税额 = 年薪 × 适用税率 - 速算扣除数。
如果员工在发放年薪的当月工资薪金所得低于税法规定的费用扣除额，则应纳税额 = （年薪 - （年薪与费用扣除额的差额）） × 适用税率 - 速算扣除数。
具体步骤：
确定年薪构成 ：包括基本工资、绩效工资、津贴等部分。制定发薪计划：
详细列出每个员工的基本工资、绩效工资及发放时间。
按期发放基本工资：
每月固定日期发放基本工资。
绩效评估与调整：
年底进行绩效评估，调整绩效工资。
其他福利待遇发放：
如津贴、奖金等，按公司规定发放。
发薪记录与报税：
记录每笔工资发放，并代扣代缴个人所得税。
示例计算：
假设某员工年薪为120,000元，个人所得税费用扣除额为5,000元。
每月预付工资
：120,000元 / 12个月 = 10,000元/月
年终结算：剩余年薪为120,000元 - （10,000元 × 11个月） = 10,000元
个人所得税计算
由于每月工资高于5,000元，适用税率为10%，速算扣除数为2,100元。
年终一次性奖金10,000元的个人所得税 = 10,000元 × 10% - 2,100元 = -1,100元（即无需缴税）
通过以上步骤和计算，企业可以按规定及时、准确地发放工资，并代扣代缴个人所得税，确保员工收入合法合规。